Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGS1P23219 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGS1P23219 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGS1P23219 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGS1P23219 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGS1P23219 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGS1P23219 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGS1P23219 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGS1P23219 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGS1P23219 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGS1P23219 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGS1P23219 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGS1P23219 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGS1P23219 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGS1P23219 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGS1P23219 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGS1P23219 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGS1P23219 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGS1P23219 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGS1P23219 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGS1P23219 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGS1P23219 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGS1P23219 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGS1P23219 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGS1P23219 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGS1P23219 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGS1P23219 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGS1P23219 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGS1P23219 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGS1P23219 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGS1P23219 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGS1P23219 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGS1P23219 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGS1P23219 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGS1P23219 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGS1P23219 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGS1P23219 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGS1P23219 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGS1P23219 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGS1P23219 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGS1P23219 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGS1P23219 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGS1P23219 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGS1P23219 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGS1P23219 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGS1P23219 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGS1P23219 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGS1P23219 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGS1P23219 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGS1P23219 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGS1P23219 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGS1P23219 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGS1P23219 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGS1P23219 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGS1P23219 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGS1P23219 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGS1P23219 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGS1P23219 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGS1P23219 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGS1P23219 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGS1P23219 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGS1P23219 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGS1P23219 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGS1P23219 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGS1P23219 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGS1P23219 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGS1P23219 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGS1P23219 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGS1P23219 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGS1P23219 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGS1P23219 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGS1P23219 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGS1P23219 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGS1P23219 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGS1P23219 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGS1P23219 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGS1P23219 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGS1P23219 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGS1P23219 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGS1P23219 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGS1P23219 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGS1P23219 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGS1P23219 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGS1P23219 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGS1P23219 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGS1P23219 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGS1P23219 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGS1P23219 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGS1P23219 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGS1P23219 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGS1P23219 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGS1P23219 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGS1P23219 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGS1P23219 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGS1P23219 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGS1P23219 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGS1P23219 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGS1P23219 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGS1P23219 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGS1P23219 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms