Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFNA1P20827 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms