Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCNA2P20248 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms