Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms