Protein–RNA interactions for Protein: P11274

BCR, Breakpoint cluster region protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCRP11274 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCRP11274 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCRP11274 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BCRP11274 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCRP11274 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCRP11274 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCRP11274 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCRP11274 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCRP11274 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCRP11274 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BCRP11274 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCRP11274 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCRP11274 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCRP11274 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCRP11274 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCRP11274 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCRP11274 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCRP11274 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCRP11274 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCRP11274 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCRP11274 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCRP11274 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCRP11274 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCRP11274 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCRP11274 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BCRP11274 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCRP11274 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BCRP11274 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCRP11274 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCRP11274 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCRP11274 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCRP11274 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCRP11274 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCRP11274 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCRP11274 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCRP11274 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCRP11274 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCRP11274 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCRP11274 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCRP11274 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCRP11274 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BCRP11274 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCRP11274 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCRP11274 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCRP11274 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCRP11274 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCRP11274 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCRP11274 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCRP11274 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCRP11274 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCRP11274 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCRP11274 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BCRP11274 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCRP11274 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCRP11274 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCRP11274 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCRP11274 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCRP11274 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCRP11274 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCRP11274 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCRP11274 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCRP11274 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCRP11274 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCRP11274 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCRP11274 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCRP11274 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCRP11274 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BCRP11274 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BCRP11274 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCRP11274 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCRP11274 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCRP11274 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCRP11274 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCRP11274 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCRP11274 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCRP11274 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCRP11274 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCRP11274 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCRP11274 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCRP11274 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCRP11274 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCRP11274 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCRP11274 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCRP11274 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCRP11274 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCRP11274 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCRP11274 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BCRP11274 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BCRP11274 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCRP11274 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCRP11274 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCRP11274 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCRP11274 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BCRP11274 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCRP11274 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCRP11274 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCRP11274 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCRP11274 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCRP11274 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCRP11274 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms