Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM200BP0CF97 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM200BP0CF97 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM200BP0CF97 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM200BP0CF97 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM200BP0CF97 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM200BP0CF97 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM200BP0CF97 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM200BP0CF97 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM200BP0CF97 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM200BP0CF97 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM200BP0CF97 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM200BP0CF97 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM200BP0CF97 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM200BP0CF97 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM200BP0CF97 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM200BP0CF97 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM200BP0CF97 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM200BP0CF97 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM200BP0CF97 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM200BP0CF97 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM200BP0CF97 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM200BP0CF97 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM200BP0CF97 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM200BP0CF97 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM200BP0CF97 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM200BP0CF97 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM200BP0CF97 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM200BP0CF97 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM200BP0CF97 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM200BP0CF97 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM200BP0CF97 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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