Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NGFRP08138 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NGFRP08138 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NGFRP08138 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NGFRP08138 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NGFRP08138 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NGFRP08138 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NGFRP08138 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NGFRP08138 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NGFRP08138 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NGFRP08138 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NGFRP08138 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NGFRP08138 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NGFRP08138 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NGFRP08138 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NGFRP08138 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NGFRP08138 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NGFRP08138 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NGFRP08138 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NGFRP08138 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NGFRP08138 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NGFRP08138 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NGFRP08138 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NGFRP08138 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NGFRP08138 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NGFRP08138 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NGFRP08138 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NGFRP08138 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NGFRP08138 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NGFRP08138 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NGFRP08138 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NGFRP08138 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NGFRP08138 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NGFRP08138 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NGFRP08138 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NGFRP08138 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NGFRP08138 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NGFRP08138 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NGFRP08138 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NGFRP08138 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NGFRP08138 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NGFRP08138 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NGFRP08138 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NGFRP08138 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NGFRP08138 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NGFRP08138 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NGFRP08138 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NGFRP08138 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NGFRP08138 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NGFRP08138 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NGFRP08138 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NGFRP08138 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NGFRP08138 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NGFRP08138 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NGFRP08138 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NGFRP08138 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NGFRP08138 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NGFRP08138 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NGFRP08138 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NGFRP08138 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NGFRP08138 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NGFRP08138 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NGFRP08138 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NGFRP08138 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NGFRP08138 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NGFRP08138 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NGFRP08138 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NGFRP08138 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NGFRP08138 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NGFRP08138 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NGFRP08138 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NGFRP08138 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NGFRP08138 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NGFRP08138 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NGFRP08138 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NGFRP08138 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NGFRP08138 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NGFRP08138 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NGFRP08138 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NGFRP08138 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NGFRP08138 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NGFRP08138 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NGFRP08138 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NGFRP08138 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NGFRP08138 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NGFRP08138 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NGFRP08138 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NGFRP08138 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NGFRP08138 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NGFRP08138 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NGFRP08138 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NGFRP08138 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NGFRP08138 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NGFRP08138 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NGFRP08138 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NGFRP08138 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NGFRP08138 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NGFRP08138 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NGFRP08138 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NGFRP08138 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms