Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIA4O75335 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms