Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRGAP3O43295 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRGAP3O43295 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRGAP3O43295 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRGAP3O43295 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SRGAP3O43295 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRGAP3O43295 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRGAP3O43295 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRGAP3O43295 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRGAP3O43295 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRGAP3O43295 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SRGAP3O43295 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRGAP3O43295 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRGAP3O43295 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRGAP3O43295 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRGAP3O43295 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRGAP3O43295 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRGAP3O43295 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRGAP3O43295 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms