Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLXNB1O43157 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms