Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4DXG7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4DXG7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4DXG7 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4DXG7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4DXG7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4DXG7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4DXG7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4DXG7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4DXG7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4DXG7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4DXG7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4DXG7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
B4DXG7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
B4DXG7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
B4DXG7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
B4DXG7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
B4DXG7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
B4DXG7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
B4DXG7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
B4DXG7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
B4DXG7 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
B4DXG7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
B4DXG7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
B4DXG7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
B4DXG7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
B4DXG7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
B4DXG7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
B4DXG7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
B4DXG7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
B4DXG7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
B4DXG7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
B4DXG7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
B4DXG7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
B4DXG7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
B4DXG7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
B4DXG7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
B4DXG7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
B4DXG7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
B4DXG7 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
B4DXG7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
B4DXG7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
B4DXG7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
B4DXG7 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
B4DXG7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
B4DXG7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
B4DXG7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
B4DXG7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
B4DXG7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
B4DXG7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
B4DXG7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
B4DXG7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
B4DXG7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
B4DXG7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
B4DXG7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
B4DXG7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
B4DXG7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
B4DXG7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
B4DXG7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
B4DXG7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
B4DXG7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
B4DXG7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
B4DXG7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
B4DXG7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
B4DXG7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
B4DXG7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
B4DXG7 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
B4DXG7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
B4DXG7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
B4DXG7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
B4DXG7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
B4DXG7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
B4DXG7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
B4DXG7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
B4DXG7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
B4DXG7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
B4DXG7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
B4DXG7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
B4DXG7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
B4DXG7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
B4DXG7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
B4DXG7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
B4DXG7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
B4DXG7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
B4DXG7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
B4DXG7 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
B4DXG7 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
B4DXG7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
B4DXG7 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
B4DXG7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
B4DXG7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
B4DXG7 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
B4DXG7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
B4DXG7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
B4DXG7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
B4DXG7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
B4DXG7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
B4DXG7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
B4DXG7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
B4DXG7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms