Protein–RNA interactions for Protein: A6NGE7

URAD, Putative 2-oxo-4-hydroxy-4-carboxy-5-ureidoimidazoline decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
URADA6NGE7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
URADA6NGE7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
URADA6NGE7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms