Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms