Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 HNRNPU-219ENST00000639628 4546 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AL450992.1-201ENST00000432386 4109 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ANKRD20A11P-206ENST00000451663 3717 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP1A2-202ENST00000392233 3338 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ALOX5-201ENST00000374391 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 PDE1B-203ENST00000538346 1711 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 CICP22-201ENST00000432801 1319 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 NUP62-208ENST00000596217 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 HSPA2-202ENST00000394709 5400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC018647.2-201ENST00000605778 4200 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AOAH-210ENST00000617267 2398 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 FOXN1-201ENST00000226247 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 NOL10-205ENST00000538384 3418 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC010328.1-201ENST00000596769 4060 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 DAPK1-209ENST00000472284 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC010536.1-201ENST00000538868 2611 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 BRD1-202ENST00000404034 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AMER3-201ENST00000321420 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 FIGNL1-214ENST00000617389 3259 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TCF21-202ENST00000367882 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 GPNMB-201ENST00000258733 2862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 CDC37L1-201ENST00000381854 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 MS4A15-202ENST00000405633 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 CTSC-203ENST00000524463 6125 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AGAP3-226ENST00000622464 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM111A-202ENST00000420244 3780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP12-205ENST00000396144 5084 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC13A2-201ENST00000314669 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 NRAP-201ENST00000359988 5580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 BAG6-237ENST00000375976 3644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 GTF2IP20-203ENST00000634905 2966 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TNS3-201ENST00000311160 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RMND5B-212ENST00000542098 1681 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SCNN1A-203ENST00000360168 3481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 NRAP-203ENST00000369358 5534 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ERI1-201ENST00000250263 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ITPRIP-203ENST00000358187 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 PLB1-201ENST00000327757 5107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TNC-203ENST00000423613 6281 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC22A6-202ENST00000377871 2151 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 PLD5-204ENST00000442594 3305 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 MTMR3-201ENST00000323630 5866 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 GNRH2-201ENST00000245983 425 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 GNRH2-202ENST00000359100 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SKP176-201ENST00000363673 318 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RPS19P1-201ENST00000415286 434 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AL356356.1-201ENST00000442435 665 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AL358176.5-201ENST00000442611 385 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 C11orf94-201ENST00000449465 369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC02051-201ENST00000456535 690 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL513P-201ENST00000465715 298 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL798P-201ENST00000468562 301 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 HLA-DPB2-206ENST00000470997 776 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL751P-201ENST00000473281 284 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL782P-201ENST00000476421 294 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL659P-201ENST00000483093 299 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL166P-201ENST00000489872 280 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL766P-201ENST00000494719 309 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AP000911.1-205ENST00000527712 594 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AL358334.1-201ENST00000557152 174 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 DNM1P28-201ENST00000565702 474 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms