Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR5

KRTAP4-2, Keratin-associated protein 4-2, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-2Q9BYR5 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 TOGARAM1-202ENST00000361577 6247 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 LAMP2-202ENST00000371335 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 FAM161A-203ENST00000405894 3684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 PI4KB-202ENST00000368873 3340 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 PTPRN-204ENST00000423636 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC37A3-202ENST00000340308 2955 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 CUX1-221ENST00000622516 2990 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 KCNJ3-201ENST00000295101 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 GNPAT-201ENST00000366647 2643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC22A14-202ENST00000448498 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 MARCH10-201ENST00000311269 3090 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 TCHP-202ENST00000405876 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 ZSCAN30-202ENST00000420878 4323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 PIK3R5-218ENST00000611902 4339 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 DPCR1-203ENST00000636043 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 ITGA6-203ENST00000409532 3544 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 TNS1-221ENST00000615025 6488 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 ZIC4-202ENST00000425731 3979 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 PCBP2-206ENST00000455667 2741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 PYGL-205ENST00000532462 2711 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 DOCK8-201ENST00000382329 6124 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 LLGL2-205ENST00000577200 3192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 KCNE1B-202ENST00000618699 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 UMODL1-205ENST00000408910 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC6A1-201ENST00000287766 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 MRVI1-214ENST00000534266 2824 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 KCNMA1-240ENST00000638575 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 KCNMA1-245ENST00000638759 3723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 KCNMA1-264ENST00000639544 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 CLSTN3-201ENST00000266546 4185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 KCNJ10-201ENST00000368089 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 PRKG2-201ENST00000264399 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 RAP1GAP-201ENST00000290101 3584 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 HELQ-201ENST00000295488 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 AC134772.2-202ENST00000634384 3585 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 PLEKHM1P1-205ENST00000582986 5014 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 ZG16-201ENST00000400752 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 AC010307.3-202ENST00000515122 3142 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 IGF1R-201ENST00000268035 11803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC25A25-205ENST00000432073 3678 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 FRAS1-201ENST00000325942 7142 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 BOD1L1-201ENST00000040738 10565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 AL109976.1-201ENST00000621919 5678 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 CLPB-201ENST00000294053 3240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 GRIK1-206ENST00000399913 3234 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 KCNK5-201ENST00000359534 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 GLRA4-201ENST00000372617 1795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 LINC00402-201ENST00000419499 3340 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 DLEC1-201ENST00000308059 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 DNMBP-201ENST00000324109 6400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 SRC-201ENST00000358208 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 MAP2K4-202ENST00000415385 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 CES2-202ENST00000417689 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 JADE1-203ENST00000452328 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 EXT2-201ENST00000343631 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 ELOVL2-201ENST00000354666 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 SMG7-214ENST00000508461 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 PCCB-214ENST00000478469 4502 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 FLNA-202ENST00000360319 8281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 PIK3R3-201ENST00000262741 5609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 INTS13-201ENST00000261191 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 TIGIT-201ENST00000383671 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 AC009336.2-201ENST00000468418 3521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 DCTN1-227ENST00000633691 4160 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 CYP2B6-201ENST00000324071 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 DQX1-201ENST00000393951 2540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 ESRP1-202ENST00000423620 3746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 ELOVL7-201ENST00000425382 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 RAB29-202ENST00000367139 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 PFKFB3-203ENST00000379775 4483 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 ST6GAL1-215ENST00000457772 3947 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 SHPRH-206ENST00000438092 6994 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 WIPF3-203ENST00000409290 4002 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 TTC39A-201ENST00000262675 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 TMEM132D-201ENST00000389441 5305 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 KLHL1-201ENST00000377844 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP4-2Q9BYR5 MYO18B-201ENST00000335473 8565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms