Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC61Q9Y6R9 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC61Q9Y6R9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC61Q9Y6R9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC61Q9Y6R9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC61Q9Y6R9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC61Q9Y6R9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC61Q9Y6R9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC61Q9Y6R9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC61Q9Y6R9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC61Q9Y6R9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC61Q9Y6R9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC61Q9Y6R9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC61Q9Y6R9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC61Q9Y6R9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC61Q9Y6R9 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC61Q9Y6R9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC61Q9Y6R9 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC61Q9Y6R9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC61Q9Y6R9 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC61Q9Y6R9 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC61Q9Y6R9 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC61Q9Y6R9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC61Q9Y6R9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC61Q9Y6R9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC61Q9Y6R9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC61Q9Y6R9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC61Q9Y6R9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC61Q9Y6R9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC61Q9Y6R9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC61Q9Y6R9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC61Q9Y6R9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC61Q9Y6R9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC61Q9Y6R9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC61Q9Y6R9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC61Q9Y6R9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC61Q9Y6R9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC61Q9Y6R9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC61Q9Y6R9 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC61Q9Y6R9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC61Q9Y6R9 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC61Q9Y6R9 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC61Q9Y6R9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC61Q9Y6R9 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC61Q9Y6R9 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC61Q9Y6R9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC61Q9Y6R9 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC61Q9Y6R9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC61Q9Y6R9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC61Q9Y6R9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC61Q9Y6R9 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms