Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms