Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT172Q9UG01 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms