Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRMT1Q9NXH9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRMT1Q9NXH9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRMT1Q9NXH9 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRMT1Q9NXH9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRMT1Q9NXH9 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRMT1Q9NXH9 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRMT1Q9NXH9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRMT1Q9NXH9 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMT1Q9NXH9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMT1Q9NXH9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMT1Q9NXH9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMT1Q9NXH9 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMT1Q9NXH9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMT1Q9NXH9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMT1Q9NXH9 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMT1Q9NXH9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMT1Q9NXH9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMT1Q9NXH9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMT1Q9NXH9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMT1Q9NXH9 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMT1Q9NXH9 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMT1Q9NXH9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMT1Q9NXH9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMT1Q9NXH9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMT1Q9NXH9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMT1Q9NXH9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMT1Q9NXH9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMT1Q9NXH9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMT1Q9NXH9 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMT1Q9NXH9 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMT1Q9NXH9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMT1Q9NXH9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMT1Q9NXH9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMT1Q9NXH9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMT1Q9NXH9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMT1Q9NXH9 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMT1Q9NXH9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRMT1Q9NXH9 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRMT1Q9NXH9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRMT1Q9NXH9 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRMT1Q9NXH9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRMT1Q9NXH9 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRMT1Q9NXH9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRMT1Q9NXH9 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRMT1Q9NXH9 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRMT1Q9NXH9 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRMT1Q9NXH9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRMT1Q9NXH9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRMT1Q9NXH9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms