Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWA0

MED9, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED9Q9NWA0 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED9Q9NWA0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED9Q9NWA0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MED9Q9NWA0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED9Q9NWA0 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED9Q9NWA0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED9Q9NWA0 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED9Q9NWA0 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED9Q9NWA0 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED9Q9NWA0 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED9Q9NWA0 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED9Q9NWA0 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED9Q9NWA0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED9Q9NWA0 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED9Q9NWA0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED9Q9NWA0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED9Q9NWA0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED9Q9NWA0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED9Q9NWA0 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED9Q9NWA0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED9Q9NWA0 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED9Q9NWA0 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED9Q9NWA0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED9Q9NWA0 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms