Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV06

DCAF13, DDB1- and CUL4-associated factor 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF13Q9NV06 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCAF13Q9NV06 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
DCAF13Q9NV06 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCAF13Q9NV06 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCAF13Q9NV06 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCAF13Q9NV06 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DCAF13Q9NV06 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms