Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms