Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOXF2Q9BQY4 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms