Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TREX2Q9BQ50 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms