Protein–RNA interactions for Protein: Q99616

CCL13, C-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL13Q99616 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL13Q99616 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms