Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms