Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LRRIQ1Q96JM4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LRRIQ1Q96JM4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LRRIQ1Q96JM4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LRRIQ1Q96JM4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LRRIQ1Q96JM4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LRRIQ1Q96JM4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LRRIQ1Q96JM4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LRRIQ1Q96JM4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LRRIQ1Q96JM4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LRRIQ1Q96JM4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LRRIQ1Q96JM4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LRRIQ1Q96JM4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LRRIQ1Q96JM4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LRRIQ1Q96JM4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LRRIQ1Q96JM4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
LRRIQ1Q96JM4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LRRIQ1Q96JM4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LRRIQ1Q96JM4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LRRIQ1Q96JM4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LRRIQ1Q96JM4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LRRIQ1Q96JM4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LRRIQ1Q96JM4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LRRIQ1Q96JM4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LRRIQ1Q96JM4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LRRIQ1Q96JM4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
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