Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC3

PYDC1, Pyrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYDC1Q8WXC3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PYDC1Q8WXC3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PYDC1Q8WXC3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PYDC1Q8WXC3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PYDC1Q8WXC3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PYDC1Q8WXC3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PYDC1Q8WXC3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PYDC1Q8WXC3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PYDC1Q8WXC3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PYDC1Q8WXC3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms