Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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NUP35Q8NFH5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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NUP35Q8NFH5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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NUP35Q8NFH5 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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NUP35Q8NFH5 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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NUP35Q8NFH5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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NUP35Q8NFH5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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NUP35Q8NFH5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NUP35Q8NFH5 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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