Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A3Q8NEV1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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