Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z569

BRAP, BRCA1-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAPQ7Z569 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRAPQ7Z569 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRAPQ7Z569 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRAPQ7Z569 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRAPQ7Z569 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRAPQ7Z569 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRAPQ7Z569 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRAPQ7Z569 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRAPQ7Z569 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRAPQ7Z569 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRAPQ7Z569 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRAPQ7Z569 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRAPQ7Z569 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRAPQ7Z569 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRAPQ7Z569 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRAPQ7Z569 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRAPQ7Z569 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRAPQ7Z569 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRAPQ7Z569 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BRAPQ7Z569 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRAPQ7Z569 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRAPQ7Z569 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRAPQ7Z569 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRAPQ7Z569 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRAPQ7Z569 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRAPQ7Z569 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRAPQ7Z569 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRAPQ7Z569 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRAPQ7Z569 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRAPQ7Z569 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRAPQ7Z569 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRAPQ7Z569 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRAPQ7Z569 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRAPQ7Z569 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms