Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGC8

CHST3, Carbohydrate sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST3Q7LGC8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CHST3Q7LGC8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHST3Q7LGC8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHST3Q7LGC8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHST3Q7LGC8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHST3Q7LGC8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHST3Q7LGC8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHST3Q7LGC8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHST3Q7LGC8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHST3Q7LGC8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHST3Q7LGC8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHST3Q7LGC8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHST3Q7LGC8 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CHST3Q7LGC8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHST3Q7LGC8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHST3Q7LGC8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHST3Q7LGC8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHST3Q7LGC8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHST3Q7LGC8 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHST3Q7LGC8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHST3Q7LGC8 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHST3Q7LGC8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CHST3Q7LGC8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CHST3Q7LGC8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHST3Q7LGC8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHST3Q7LGC8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHST3Q7LGC8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHST3Q7LGC8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHST3Q7LGC8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHST3Q7LGC8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHST3Q7LGC8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHST3Q7LGC8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHST3Q7LGC8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHST3Q7LGC8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHST3Q7LGC8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHST3Q7LGC8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms