Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRT80Q6KB66 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms