Protein–RNA interactions for Protein: Q63HK3

ZKSCAN2, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 2, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN2Q63HK3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZKSCAN2Q63HK3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms