Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RPRD2Q5VT52 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms