Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms