Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms