Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LONRF3Q496Y0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LONRF3Q496Y0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms