Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF212Q495C1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms