Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXY8

ARL13B, ADP-ribosylation factor-like protein 13B, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL13BQ3SXY8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ARL13BQ3SXY8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARL13BQ3SXY8 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARL13BQ3SXY8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARL13BQ3SXY8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARL13BQ3SXY8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARL13BQ3SXY8 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARL13BQ3SXY8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARL13BQ3SXY8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARL13BQ3SXY8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARL13BQ3SXY8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARL13BQ3SXY8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARL13BQ3SXY8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARL13BQ3SXY8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ARL13BQ3SXY8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARL13BQ3SXY8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARL13BQ3SXY8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARL13BQ3SXY8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARL13BQ3SXY8 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARL13BQ3SXY8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARL13BQ3SXY8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARL13BQ3SXY8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARL13BQ3SXY8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARL13BQ3SXY8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARL13BQ3SXY8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARL13BQ3SXY8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms