Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL40Q2TBA0 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms