Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
IMPG1Q17R60 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
IMPG1Q17R60 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
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