Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SGCBQ16585 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SGCBQ16585 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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