Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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CNGA3Q16281 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNGA3Q16281 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
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CNGA3Q16281 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
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CNGA3Q16281 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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