Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SNCBQ16143 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNCBQ16143 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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