Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PDCD1Q15116 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD1Q15116 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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