Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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BRD3Q15059 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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BRD3Q15059 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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BRD3Q15059 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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BRD3Q15059 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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BRD3Q15059 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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BRD3Q15059 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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BRD3Q15059 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRD3Q15059 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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