Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD1Q15011 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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