Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB39AQ14964 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms