Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
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